Уникальной особенностью территории Перелучского заказника является контрастное сочетание положительных форм рельфа – камов с обширным (2,9 тыс.га), понижением – Болонской Заболотью, сформировавшейся в долине реки Уверь при соединении рек Съежа, Редеха, Медведа.
С лесистых холмов открывается впечатляющий пейзаж огромной чаши лугов и вод, простирающихся до горизонта и завершающихся опять лесистыми холмами. Этот пойменный разлив – наиболее крупный в Новгородской области (после Ильменских и Волховской поймы), в восточной части – единственный.
Заказник находится на аккумулятивной территории бассейна реки Мста, в нижнем течении ее правого притока р. Уверь. Река Уверь принимает здесь воды левых своих притоков – р. Сьежа, р. Редеха, р. Медведа, мелких водотоков.
